La Calanque abrite le cortège floristique emblématique de l’ensemble du massif. Ce sont les pins d’Alep qui dominent le paysage. Ils vont même jusqu’à reconquérir le carreau et le front de taille de la carrière. On peut distinguer plusieurs ensembles floristiques répartis le long du littoral de Port-Miou :
- En fond de Calanque, sur les falaises et rives rocheuses non remaniées par l’activité des carrières, particulièrement sur la rive Est, subsiste une garrigue littorale peuplée d’une association de filaires à feuilles étroites, nerpruns alaternes, chênes kermès, pistachiers lentisques… Ce sont majoritairement des arbustes persistants méditerranéens.
- Sur les talus rudéralisés, le pin d’Alep colonise les remblais d’une jeune pinède, avec des sous-bois peuplés de romarins, Sumacs des corroyeurs, coronilles à tiges de joncs, stéhelines….
- Sur les terre-pleins sablonneux, parfois inondés en hiver, se développent thyms, linules visqueuses, ophrys mais aussi des orchidées rares et protégées comme la sérapias à petites fleurs
- En bordure littorale, les groupements halophytes où l’on retrouve le statice nain de Provence, la crithme maritime qui se répartissent sous l’influence des embruns
- Le fond du Vallon de Gorgue-Longue peuplé d’arbustes et arbres méditerranéens : myrtes noires et blanches, érables de Montpellier, frênes à fleurs, chênes verts
- Les éboulis où se localise la sabline de Provence, endémique et protégée.
Quelques plantes communes dans la Calanque: